生物科学

随着测序技术与方法的进步，测定个人全基因组序列不再遥不可及。目前，获得一个人全部的基因序列只需要数千美金既可实现。面对海量的基因数据，单凭人脑与纸张已无法满足计算与分析的要求。生物信息学由此诞生，它代表着分子生物学与计算机学的交叉结合。《生物信息学和功能基因组学》正是一本详细讲解利用计算机算法分析蛋白与基因结构和功能的教材，由Wiley出版社出版，其作者是来自肯尼迪•克里格研究所从事基因表达谱相关研究多年的Jonathan Pevsner。

本书分为三部分。第一部分主要讲解如何获取生物序列数据，特别是DNA和蛋白质序列。一旦获得了相关数据，如何比较两组甚至更多组数据的相似度。作者还在本部分介绍如何进行多重蛋白序列与核苷酸序列比较并以系统树的方式加以呈现。第二部分重点展示功能基因组学方面的内容，包括DNA、RNA、蛋白质三个层面。DNA部分主要介绍下一代测序技术，RNA部分重点阐述利用微阵列与RNA测序测量mRNA，随后蛋白质部分作者讲述蛋白结构与蛋白质家族的分析以及蛋白组学同基因组学，转录组学的整合。第三部分囊括了系统树的基因组分析。自1995年起，人类获得了上千种生物基因组序列，包括病毒、细菌、古细菌和真核生物。本部分提供多个数据库资源供读者获取不同种生物的基因组数据，并论述如何对不同类的真核生物的基因组进行比较分析，最后，本书会探索生物信息学在人类疾病领域的应用。

理论与实战并进是本书的一大特点。如前所述，生物信息学是依靠计算机来对生物数据进行分析的学科，因此本书将基于网络的分析软件与命令行软件两大类分析手段的使用方法穿插在各章进行讲解。每章都包括实战案例供读者参考，同时，教材中所有的图表都是由书中讲解步骤绘制而成，读者可从官方网站获取原始数据，自行绘制图表以作练习。

本书第一版于2003年出版，相较前两版书，第三版更强调了计算机工具的重要性，更注重将理论应用于实践，使得读者掌握使用软件分析生物序列与数据的方法。本书适合有一定生物学基础、从事基因组相关研究工作的人员阅读。