生命科学

Pinhasi_9780470747308
《演化至农业时代的人类生物考古学》

Human Bioarchaeology of the Transition to Agriculture
Ron Pinhasi等主编
2011年2月,500页,ISBN: 9780470747308
书评者: 魏玉保,博士生(中科院遗传发育所)
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考古学证据表明,农业起源于一万年前的新石器晚期和全新世早期;当然,人类驯化动植物的历史从几十万年前就开始了。本书由著名人类学家Clark. S. Larson作序,他总结道“关于农业起源,没有统一的生物学原则和模式……本书对于理解全新世以来人类的演化是不可或缺的,阐明一万年来生存条件的变化有助于反观人类当前的处境”。

本书分为4部分19章。第一部分:农业内在的转变,含第2-6章。第二部分:古人类生长发育和体型的变异,含第7-10章。第三部分:生物力学和人类习性的指示,含第11-14章。第4部分:考古遗传学、古人口学、头骨和牙齿的形态学,含第15-19章。 1.农业演变研究范式的变化:人类生物考古学,行为与适应;2. 中石器到新石器的演变:欧洲大陆相关遗址的同位素分析;3. 东欧中石器到新石器的演变:基于稳定性同位素的食性分析和古病理学来揭示生存策略和经济;4. 新石器时期的气候变化、狩猎活动与刀耕火种:人类和动物遗骨的稳定性同位素分析;5. 希腊新石器时期人类骨骼材料反映的健康状况、食性和社会发展;6. 生物考古学研究中、晚上新世时期南非开普角东部人类的演替;7. 欧洲晚更新世和早全新世时期人类长骨的长度、身高和年代研究;8. 中石器和新石器时期东南欧的长骨生长模式和比例的异同;9.农业大扩展时期的北美人类身材、体格、体型演变;10.史前农业演变时期日本人颅下形态的演化;11. 西伯利亚中全新世人类生活习性和食性变化的生物考古学研究;12. 重要的外部条件:北美东部农业对采集到耕种方式过渡的促进;13. 新石器时期意大利西北地区牧民的流动性和较低的肢体健康状况;14.旧石器晚期至中王朝时期尼罗河谷地古埃及人的体格、骨骼测量、生活习性和居群活动;15. 新石器时期欧洲的人类、家畜与畜牧业(奶业)的古群体遗传学研究;16. 瑞典南部新石器时期狩猎-采集和农耕异质性及其过渡的遗传学研究;17. 黎凡特南部前陶器时期人群的古人口学研究:区域和时域视角;18. 安第斯山农业最南端前哨区的古人类骨骼差异;19. 牙齿微缩与欧洲农业的过渡。

本书主编Ron Pinhasi是爱尔兰Cork大学考古学系的教授, Jay T. Stock是剑桥大学体质人类学系的教授;他们有着广泛的古人类学考古实践和理论研究经历。本书十分适合古人类学、生物考古学、古生物学、古病理学、农业起源领域的专家学者和研究生阅读。


Mevorach_9781573317979
《健康和病变的免疫系统对死亡细胞的清除》

Clearance of Dying Cells in a Healthy and Diseased Immune System
Dror Mevorach主编
2011年3月,252页,ISBN: 9781573317979
书评者: 魏玉保,博士生(中科院遗传发育所)
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本书是《纽约科学院年刊》的免疫学专辑,包含16篇研究论文。此专辑是2010年5月9-11日在耶路撒冷希伯来大学召开的“健康和病理条件下免疫系统对死亡细胞的清除”专题研讨会的论文集精粹。16篇综述由相关专家在此次会议报告的基础上精心撰写,对了解本领域的最新进展和发展趋势不无裨益。

16个篇目依次是1. 细胞“衰老”、“凋亡”、“坏死”、“清除死细胞”的确切含义;2. 凋亡与自身免疫性疾病;3. caspases酶的抗炎症作用;4. TAM受体和凋亡细胞的清除;5. ELMO1信号与凋亡生殖细胞的清除和配子发生;6. 凋亡细胞的清除和免疫调节;7. A型人血小板反应素与凋亡细胞的清除和免疫耐受的诱导;8. 凋亡拟态:磷脂酰丝氨酸介导的对牛痘病毒的胞饮清除;9. Th17细胞对感染和凋亡的应答;10. α整合素与调节性T细胞对凋亡细胞和自身相关抗原的免疫豁免;11. 死亡细胞与巨噬细胞相互作用中暴露于细胞表面的钙网蛋白;12. 氧化还原重塑:HMGB1对损伤的骨骼肌细胞的调节作用;13. 钙网蛋白与类风湿关节炎的病情发展;14. 癌症化疗时的细胞死亡;15.体外、体内诱导的肿瘤细胞死亡与抗肿瘤免疫应答;16. 静脉内凋亡细胞灌注的细胞疗法改善造血细胞移植结果。

本书主编Dror Mevorach是希伯来大学Hadassah医学院细胞分子免疫和风湿病学研究中心的教授。他的研究领域是自身免疫和免疫调节、死亡细胞的免疫清除与疾病。同时他是一位国际知名的风湿病学专家,专长对类风湿关节炎、红斑狼疮、抗磷脂综合症、痛风、脉管炎等疾病的诊治。

此书适合基础免疫、临床免疫学、风湿病学领域的研究人员和临床医生。


Rangwala_9780470470596
《蛋白质结构预测导论 -- 方法与算法》

Introduction to Protein Structure Prediction: Methods and Algorithms
Huzefa Rangwala等主编
2010年12月,516页,ISBN: 9780470470596
书评者: 魏玉保,博士生(中科院遗传发育所)
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从上世纪50年代分子生物学创立开始,蛋白质结构预测就一直是一个重要和富有挑战性的领域。传统的蛋白质结构解析基于X射线或核磁共振技术的使用,它们具有成本高、耗时长的弊端。现在,随着蛋白质结构数据库中已知蛋白质结构信息的迅猛增多和高性能计算技术的发展,用计算机来实现蛋白质结构预测成为可能。基于同源比对、机器学习、神经网络、结构匹配原理等的多种算法也得到了极大的发展。这些预测方法可以分为三大类:同源结构模拟(Homology Modeling)、折叠识别模拟(Fold Recognition)和基于熵最小化的从头计算方法(Ab Initio)。

本书共有20章。1. 蛋白质结构预测简介;2. 蛋白质结构预测技术评估大赛(CASP):蛋白质结构模拟技术的助推器;3. 美国蛋白质结构计划(PSI);4. 整合神经网络法预测蛋白质一维结构性质;5. 蛋白质二级结构系统;6. 跨膜蛋白的结构及其拓扑学预测;7. 机器学习法建构蛋白质残基接触图;8. 远缘同源检测和同构折叠识别方法;9. 同源比对和机器学习用于蛋白折叠识别;10. 基于TASSER程序的蛋白结构预测;11. 蛋白三级结构预测的综合策略:ITASSER示例;12. 蛋白结构预测方法的综合运用;13. 蛋白圈环结构的模拟;14. 用侧链微环境视角的统计秩序来评估蛋白模型质量;15. 蛋白质模型的定性预测;16. 配体结合残基的结构预测;17. 模拟和验证跨膜蛋白的结构;18. 基于结构的机器学习模型计算蛋白质突变;19. 蛋白质本初状态的构象搜索;20. 用MEDUSA和离散分子动力学模拟蛋白质突变。

本书主编Huzefa Rangwala是美国George Mason大学计算机系和生物工程系的副教授,研究领域是生物信息学、化学信息学、数据挖掘,包括蛋白质结构和功能预测。George Karypis教授是Huzefa Rangwala博士时期的导师,现供职于明尼苏达大学计算机系;研究领域包括数据挖掘、生物信息学、并行计算、计算机辅助设计和科学计算。他发表了百余篇论文,同时是IJDMB杂志的编委。

本书适合与蛋白质结构相关的生物信息学、生物物理学、结构生物学领域的专家学者、高年级学生和研究生。


Price_9780470712290
《大脑的发育和形成神经发育导论》

Building Brains: An Introduction to Neural Development
David Price 等著
2011年4月,348页,ISBN: 9780470712290
书评者: 魏玉保,博士生(中科院遗传发育所)
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从原肠胚到神经胚,胚胎的层次结构、发育调控骤然复杂起来。固然过去的一个世纪里神经生物学取得了巨大的进展,神经胚的发育过程和神经系统的胚后发育依然是一个富有挑战性的研究领域。这些进展不仅有助于阐明生物体的发育过程,也有助于开发相应医疗技术和疗治神经系统的病痛。像自闭症、癫痫、精神分裂症,现在依然缺乏根治的良方。它们的根治有赖于神经发育基础研究的迅猛进展。

本书共有12章。1. 研究神经发育的动物模型和方法;2. 不同动物神经系统的发育与解剖;3. 神经诱导:胞间信号决定细胞命运的经典案例;4. 神经外胚层的模式建成;5. 神经再生:神经细胞的生发;6. 神经细胞的迁移;7. 神经元的形态如何形成;8. 轴突引导与延伸;9. 大脑图式及其功能的形成;10. 功能性特征的成熟;11. 神经系统发育过程中的细胞生长和死亡;12. 环境刺激依赖的神经发育。

本书具有以下特点:涵盖当前神经发育领域的核心进展,强调发育的共有机制,并给出了进一步阅读的文献。正文扩展框包含了3个方面:近年来重要进展;有争议的科学问题;发育异常造成的神经疾病。研究神经发育的主流技术,如转基因、高端显微镜和计算机建模也有所涉及。内容选取上,在哺乳动物与非哺乳动物间平衡选取;从果蝇到人,9种模式生物都有涉及。全书富含帮助理解的彩色图表,每章页边有扩展的词汇表,章后有内容提要式的总结。读者还可以利用本书相关的网址集成,包括书中图片库的网址,来做延伸阅读。

此书十分适合生物学专业的高年级学生和神经生物专业的研究生;毋容置疑,对神经发育感兴趣的其他专业人士也能够兴趣盎然地欣赏这一佳作。


Stein_9780470595459
《人类干细胞技术与生物学(研究指南和实验室手册)》

Human Stem Cell Technology and Biology: A Research Guide and Laboratory Manual
Gary S. Stein等编著
2010年12月,419页,ISBN: 9780470595459
书评者: 魏玉保,博士生(中科院遗传发育所)
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如何建立自己的干细胞实验室?如何开展前沿性的干细胞研究?干细胞未来10年的方向在哪里?答案都可以在这部论文集里找到。本书作者既有干细胞领域的权威专家,如Robert Lanza、Gary Stein;也有后起之秀,如Li-Fang Chu。全书体例、风格统一,每个章节都由分工明确的作者们反复修改、精心写就。

本书分为5部分31章;每章篇幅虽然短小,但都十分精要。第1部分:导论,含第1-2章。1. 多能干细胞:理论基础与应用;2. 干细胞研究的法规和细胞系获取。第2部分:人类多能干细胞培养的实验室指南,含第3-11章。3. 细胞培养基础;4. 干细胞实验室组成;5. 试剂与培养液;6. 用于人类胚胎干细胞培养的小鼠胚胎成纤维细胞饲养层的制备;7. 小鼠胚胎成纤维细胞的解冻与铺板;8. 人类胚胎干细胞的解冻、铺板和换液;9. 人类胚胎干细胞在小鼠胚胎成纤维细胞饲养层培养板中的传代;10. 人类胚胎干细胞的收获与冻存;11. 使用BD Matrigel基质和mTeSR培养基培养人类胚胎干细胞。第3部分:人类多能干细胞的特性测定,含第12-19章。12. 细胞多能性的定义; 13. 荧光显微镜下人类胚胎干细胞的特征;14.用于流式细胞仪分析的人类胚胎干细胞样品的制备;15. 用反转录PCR分析人类胚胎干细胞的基因表达;16. 类胚体形成实验鉴定人类胚胎干细胞多能性;17. 人胚胎干细胞的细胞遗传学分析——核型和荧光原位杂交;18. 高分辨率染色质免疫沉淀反应化验;19. 畸胎瘤形成实验鉴定多能性。第4部分:人类胚胎干细胞技术展望,含第20-25章。20. 多能性干细胞的基因组分析;21. 人类多能性干细胞的蛋白质组分析;22. 基因表达分析的生物信息学策略;23. 多能性干细胞的表观遗传学分析;24. 多能干细胞的分化;25. 细胞重编程:当前技术、展望和诱导多能干细胞。第5部分:人类胚胎干细胞的应用,含第26-31章。26. 人类多能性细胞多能性的理论基础;27. 人类多能性细胞与再生医学;28. 人类胚胎干细胞的治疗性应用;29. 人类干细胞用于药物的筛选、毒性、特异性和脱靶效应研究;30. 干细胞与基因治疗技术的对接;31. 组织工程与基于干细胞的再生医学。

随书所附的光盘包含本书相关的15个实验步骤和6个实验录像,每段录像的前几分钟的内容是Gary Stein简短的理论评述。本书适合干细胞、组织工程、再生医学、发育生物学等领域的专家学者、研究生和实验室技术人员;是干细胞实验室不可多得的理论和技术指导用书。


Tuchin_9783527409341
《先进光学流式细胞测量术》

Advanced Optical Flow Cytometry: Methods and Disease Diagnoses
Valery V. Tuchin著
2011年4月,740页,ISBN: 9783527409341
书评者: 聂树真,助理研究员(中国科学院光电研究院)
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流式细胞术从上世纪60年代发展至今,已经成为现代科学研究和临床实验中不可或缺的工具。流式细胞术(Flow Cytometry,FCM)是一种在功能水平上对单细胞或其他生物粒子进行定量分析和分选的检测手段,它可以高速分析上万个细胞,并能同时从一个细胞中测得多个参数,与传统的荧光镜检测相比,具有速度快、精度高、准确性好等优点,成为当代最先进的细胞定量分析技术。

该书着眼于非侵入式生物活体流式细胞术的最新研究进展和应用方面,特别强调了新型生物光子方法、疾病诊断和在固定和流动条件下单个细胞水平上的疾病治疗检测等。本书共20个章节,相关主题包括细胞光散射、快速视频显微镜、激光扫描、荧光、多光子、细胞诊断的光热和光声方法以及生物体的疾病治疗检测等。也对经典流式细胞术的方法和技术进行了相关的讨论和描述。全书涉及内容广泛,从光、细胞、血管组织和细胞标记颗粒之间的基本相互作用谈起一直到临床研究中的战略和机遇问题。本书适合从事细胞计量术领域的科研、实践人员、教授等阅读,也适合于生物医学物理工程、生物医学光学及生物光子学、医学科学方面的博士生和研究生作为补充辅导工具书使用阅读,本书对其他从事激光和光学工程技术、光谱学等领域的读者也会有所帮助。

作者Valery V.Tuchin:光学和生物光子学教授,俄罗斯萨拉托夫州立大学光学与生物光子学研究教育学院主任,俄罗斯航天局机械精密控制研究所技术与生命系统激光诊断实验室负责人,他的研究兴趣包括生物光子学、生物医学光学、激光医学、物理学、光学和激光测量等。


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